Xanthomonas

Xanthomonas
Description de cette image, également commentée ci-après
infection par Xanthomonas campestris 22 pv. hederae
sur feuille de lierre
Classification
Règne Bacteria
Division Proteobacteria
Classe Gammaproteobacteria
Ordre Xanthomonadales
Famille Xanthomonadaceae

Genre

Xanthomonas
Dowson, 1939

Xanthomonas est un genre de Protéobacteries de la famille des Xanthomonadaceae, dont beaucoup d'espèces causent des maladies des plantes.

Symptômes d'infection par des Xanthomonas spp.
Cycle de vie de Xanthomonas spp.

C'est un genre de bactéries très étudié, car affectant des organismes d'intérêt alimentaires et économique importants pour l'humanité.

Ainsi, des collections de référence de cultures de souches de Xanthomonas ont été rassemblées par la National Collection of Plant Pathogenic Bacteria (NCPPB) au Royaume-Uni, par l' International Collection of Microorganisms from Plants (ICMP) en Nouvelle-Zélande, par la Collection française de bactéries associées aux plantes (CFBP) en France et la Collection russe de micro-organismes (VKM) en Russie et la Microbial type culture collection and gene bank (MTCC) en Inde.

C'est par ailleurs chez cette bactérie qu'ont été découverts les domaines protéiques TALE qui sont utilisés en biotechnologie.

Pathogenèse

Xanthomonas peut infecter beaucoup d'espèces cultivées telles que le poivre, le riz, le citron, le coton, la prune, la cerise, la pêche, la tomate et le soja[1].

Certaines espèces de Xanthomonas causent des taches localisées sur les feuilles ou des cercosporioses tandis que d'autres espèces se propagent de manière systémique dans la plante (pourriture noire, maladie de la brûlure des feuilles)[2]. Ces bactéries contournent les défenses immunitaires de leurs hôtes et injectent un certain nombre de protéines effectrices (TAL effecteurs notamment), dans la plante via leur système de sécrétion de type III. Ces protéines peuvent se lier aux séquences de gènes promoteurs et activer l'expression de certains gènes de la plante d'une manière qui favorise l'infection par la bactérie.

Des plantes, notamment une variété de riz, sont en cours de sélection pour développer la résistance aux Xanthomonas. Pour cela, la technique des TALENs, justement découverte chez ce genre de bactéries, sert à créer des gènes de résistance[3],[4].

Liste d'espèces

Selon Catalogue of Life (23 juillet 2014)[5] :

Liste des espèces, sous-espèces, variétés et pathovars

Selon NCBI (23 juillet 2014)[6] :

  • Pseudomonas cissicola
  • Xanthomonas albilineans
  • Xanthomonas alfalfae
    • sous-espèce Xanthomonas alfalfae subsp. alfalfae
    • sous-espèce Xanthomonas alfalfae subsp. citrumelonis
      • pathovar Xanthomonas axonopodis pv. citrumelo F1
  • Xanthomonas arboricola
    • pathovar Xanthomonas arboricola pv. celebensis
    • pathovar Xanthomonas arboricola pv. corylina
    • pathovar Xanthomonas arboricola pv. fragariae
    • pathovar Xanthomonas arboricola pv. juglandis
    • pathovar Xanthomonas arboricola pv. populi
    • pathovar Xanthomonas arboricola pv. pruni
  • Xanthomonas axonopodis
    • pathovar Xanthomonas axonopodis pv. alfalfae
    • pathovar Xanthomonas axonopodis pv. allii
    • pathovar Xanthomonas axonopodis pv. aurantifolii
    • pathovar Xanthomonas axonopodis pv. axonopodis
    • pathovar Xanthomonas axonopodis pv. bauhiniae
    • pathovar Xanthomonas axonopodis pv. begonia
    • pathovar Xanthomonas axonopodis pv. begoniae
    • pathovar Xanthomonas axonopodis pv. betlicola
    • pathovar Xanthomonas axonopodis pv. biophyti
    • pathovar Xanthomonas axonopodis pv. cajani
    • pathovar Xanthomonas axonopodis pv. cassavae
    • pathovar Xanthomonas axonopodis pv. cassiae
    • pathovar Xanthomonas axonopodis pv. clitoriae
    • pathovar Xanthomonas axonopodis pv. commiphorae
    • pathovar Xanthomonas axonopodis pv. coracanae
    • pathovar Xanthomonas axonopodis pv. cyamopsidis
    • pathovar Xanthomonas axonopodis pv. desmodii
    • pathovar Xanthomonas axonopodis pv. desmodiigangetici
    • pathovar Xanthomonas axonopodis pv. desmodiilaxiflori
    • pathovar Xanthomonas axonopodis pv. desmodiirotundifolii
    • pathovar Xanthomonas axonopodis pv. dieffenbachiae
    • pathovar Xanthomonas axonopodis pv. erythrinae
    • pathovar Xanthomonas axonopodis pv. fascicularis
    • pathovar Xanthomonas axonopodis pv. fici
    • pathovar Xanthomonas axonopodis pv. glycines
    • pathovar Xanthomonas axonopodis pv. khayae
    • pathovar Xanthomonas axonopodis pv. lespedezae
    • pathovar Xanthomonas axonopodis pv. maculifoliigardeniae
    • pathovar Xanthomonas axonopodis pv. malvacearum
    • pathovar Xanthomonas axonopodis pv. manihotis
    • pathovar Xanthomonas axonopodis pv. martyniicola
    • pathovar Xanthomonas axonopodis pv. melhusii
    • pathovar Xanthomonas axonopodis pv. nakataecorchori
    • pathovar Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae
    • pathovar Xanthomonas axonopodis pv. patelii
    • pathovar Xanthomonas axonopodis pv. pedalii
    • pathovar Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli
    • pathovar Xanthomonas axonopodis pv. phyllanthi
    • pathovar Xanthomonas axonopodis pv. physalidicola
    • pathovar Xanthomonas axonopodis pv. poinsettiicola
    • pathovar Xanthomonas axonopodis pv. punicae
    • pathovar Xanthomonas axonopodis pv. rhynchosiae
    • pathovar Xanthomonas axonopodis pv. ricini
    • pathovar Xanthomonas axonopodis pv. rosa
    • pathovar Xanthomonas axonopodis pv. sesbaniae
    • pathovar Xanthomonas axonopodis pv. spondiae
    • pathovar Xanthomonas axonopodis pv. syngonii
    • pathovar Xanthomonas axonopodis pv. tamarindi
    • pathovar Xanthomonas axonopodis pv. vasculorum
    • pathovar Xanthomonas axonopodis pv. vignaeradiatae
    • pathovar Xanthomonas axonopodis pv. vignicola
    • pathovar Xanthomonas axonopodis pv. vitians
  • Xanthomonas bromi
  • Xanthomonas campestris
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. aberrans
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. alangii
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. amaranthicola
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. amoraciae
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. amorphophalli
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. aracearum
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. arecae
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. argemones
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. armoraciae
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. arracaciae
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. azadirachtae
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. badrii
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. barbareae
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. begoniae
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. betae
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. blepharidis
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. campestris
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. cannabis
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. cannae
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. capsularii
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. carissae
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. carotae
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. centellae
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. clerodendri
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. convolvuli
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. coriandri
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. cyanopsidis
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. daturae
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. dieffenbachiae
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. durantae
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. esculenti
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. euphorbiae
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. fici
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. glycines
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. guizotiae
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. gummisudans
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. hederae
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. heliotropii
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. incanae
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. ionidii
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. lantanae
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. lawsoniae
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. leeana
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. leersiae
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. malloti
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. merremiae
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. mirabilis
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. musacearum
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. nigromaculans
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. olitorii
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. oryzae
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. papavericola
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. parthenii
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. paulliniae
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. pelargonii
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. pennamericanum
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. phaseoli
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. phormiicola
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. physalidis
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. plantaginis
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. poinsettiicola
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. raphani
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. sesami
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. spermacoces
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. syngonii
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. thespesiae
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. thirumalacharii'
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. tribuli
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. trichodesmae
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. uppalii
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. vasculorum
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. vasicola
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. veroniae
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. viegasii
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. vignicola
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. vitians
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. viticola
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. vitiscarnosae
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. vitistrifoliae
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. vitiswoodrowii
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. zantedeschiae
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. zingibericola
    • pathovar Xanthomonas campestris pv. zinniae
  • Xanthomonas cassavae
  • groupe Xanthomonas citri group
    • Xanthomonas citri
      • pathovar Xanthomonas citri pv. anacardii
      • pathovar Xanthomonas citri pv. aurantifolii
      • pathovar Xanthomonas citri pv. bauhiniae
      • pathovar Xanthomonas citri pv. bilvae
      • pathovar Xanthomonas citri pv. cajani
      • pathovar Xanthomonas citri pv. citri
      • pathovar Xanthomonas citri pv. clitoriae
      • pathovar Xanthomonas citri pv. desmodiilaxiflori
      • pathovar Xanthomonas citri pv. glycines
      • pathovar Xanthomonas citri pv. malvacearum
      • pathovar Xanthomonas citri pv. mangiferaeindicae
      • variété Xanthomonas citri pv. phaseoli var. 'fuscans
      • pathovar Xanthomonas citri pv. rhynchosiae
      • pathovar Xanthomonas citri pv. sesbaniae
      • pathovar Xanthomonas citri pv. vignicola
      • sous-espèce Xanthomonas citri subsp. citri
      • sous-espèce Xanthomonas citri subsp. malvacearum
    • Xanthomonas fuscans
      • sous-espèce Xanthomonas fuscans subsp. aurantifolii
      • sous-espèce Xanthomonas fuscans subsp. fuscans
  • Xanthomonas codiaei
  • Xanthomonas cucurbitae
  • Xanthomonas cynarae
  • Xanthomonas dyei
    • pathovar Xanthomonas dyei pv. dysoxyli
    • pathovar Xanthomonas dyei pv. eucalypti
    • pathovar Xanthomonas dyei pv. laureliae
  • Xanthomonas euvesicatoria
  • Xanthomonas fragariae
  • Xanthomonas gardneri
  • Xanthomonas hortorum
    • pathovar Xanthomonas hortorum pv. carotae
    • pathovar Xanthomonas hortorum pv. hederae
    • pathovar Xanthomonas hortorum pv. pelargonii
    • pathovar Xanthomonas hortorum pv. taraxaci
    • pathovar Xanthomonas hortorum pv. vitians
  • Xanthomonas hyacinthi
  • Xanthomonas melonis
  • Xanthomonas oryzae
    • pathovar Xanthomonas oryzae pv oryzae
    • pathovar Xanthomonas oryzae pv. oryzicola
  • Xanthomonas perforans
  • Xanthomonas pisi
  • Xanthomonas populi
  • Xanthomonas retroflexus
  • Xanthomonas sacchari
  • Xanthomonas theicola
  • Xanthomonas translucens
    • pathovar Xanthomonas translucens pv. arrhenatheri
    • pathovar Xanthomonas translucens pv. cerealis
    • pathovar Xanthomonas translucens pv. graminis
    • pathovar Xanthomonas translucens pv. hordei
    • pathovar Xanthomonas translucens pv. phlei
    • pathovar Xanthomonas translucens pv. phleipratensis
    • pathovar Xanthomonas translucens pv. pistacia
    • pathovar Xanthomonas translucens pv. poae
    • pathovar Xanthomonas translucens pv. secalis
    • pathovar Xanthomonas translucens pv. translucens
    • pathovar Xanthomonas translucens pv. undulosa
  • Xanthomonas vasicola
    • pathovar Xanthomonas vasicola pv. vasculorum
  • Xanthomonas vesicatoria

Notes et références

  1. (en) Boch J, Bonas U, « XanthomonasAvrBs3 Family-Type III Effectors: Discovery and Function », Annual Review of Phytopathology, vol. 48,‎ , p. 419–36 (PMID 19400638, DOI 10.1146/annurev-phyto-080508-081936).
  2. Xantomonas
  3. High-efficiency TALEN-based gene editing produces disease-resistant rice, Ting Li, Bo Liun Martin H Spalding, Donald P Weeks et Bing Yang, Nature Biotechnology
  4. TALEN, ciseaux moléculaires de la nouvelle génération de NBT, info NBT
  5. Catalogue of Life Checklist, consulté le 23 juillet 2014
  6. NCBI, consulté le 23 juillet 2014

Voir aussi

Articles connexes

Liens externes

Sur les autres projets Wikimedia :

  • Xanthomonas, sur Wikimedia Commons
  • Xanthomonas, sur Wikispecies
  • (en) Référence AlgaeBase : genre Xanthomonas Scagel & J.Stein Non valide (consulté le )
  • (en) Référence Catalogue of Life : Xanthomonas Dowson, 1939 emend. Vauterin et al., 1995 emend. Vauterin & al. , 1995 (consulté le )
  • (en) Référence NCBI : Xanthomonas (taxons inclus) (consulté le )
  • (en) Référence uBio : Xanthomonas W. J. Dowson, 1939 (consulté le )

Bibliographie

  • (en) Lucia Civetta, Xanthomonas, Springer Netherlands, , 399 p. (ISBN 9789401046664).
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